توفي في يوم الجمعة 18/ 12/ 1431 يآية الله الشيخ محمد رضا الجعفري في طهران أحد أعلام الشيعة البارزين وهو من تلامذة آلسيد الخوئي والسيد الروحاني قدس سرهما.
ويعد فقد الشيخ الجعفري خسارة لاتعوض في عالم التشيع وذلك لما له من الدور البارز في الساحة العلمية النجفية والإيرانية، والحوزات العلمية فهو من أبرز مدرسي علم الكلام والإعتقاد والتأريخ الإسلامي فقد كان رحمه الله تعالى أحد الأعلام البارزين في مجال الدراسات الإسلامية، وكان معتمداً عند المراجع العظام وهو من أهل الخبرة المجتهدين، وكان ذا كفاءة عالية جداً ومحيطاً بالمكتبة الإسلامية المتنوعة، وقرأ الكثير جدا في كتب المذاهب الإسلامية وكان خبيرا بها، حتى صار مرجعا في المعارف الإسلامية فهو صاحب فكر وقلم بارع خصوصاً في رد الشبهات العقائدية، وكتب ترجمة لكتاب الكافي باللغة الإنجليزية، وعنده إحاطة بما في التوراة وعموم كتب النصارى وغيرهم فقد كان رحمه الله تعالى فريداً في علمه وإحاطته مع ما يتمتع به أيضاً من علم في الفقه والأصول فتغمد الله الفقيد بواسع رحمته وأسكنه الله فسيح جناته إنه سميع الدعاء ورحم الله من يقرأ له الفاتحة